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【世界脑炎日】mNGS时代,盘盘最新脑炎诊治流程

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发表时间:2022-02-22 17:19

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红色警戒,审慎出击。2022世界脑炎日(World Encephalitis Day),微远基因伴您同行。在这“柳絮轻扬,春风拂面”的季节里,感染性脑炎可能伺机而动,是神经系统最常见的急危重症之一,年发病率约为12.6/100,000,5-26%的患者有神经系统后遗症,死亡率高达5-10%的。40%-50%的已知原因的病例可归因于感染,其中,病毒是最常见的原因,其次是细菌。自身免疫性脑炎(AE)约占脑炎/脑膜炎病例的20-30%。快速诊断的效果无疑取决于新的诊断试验进展,例如多重PCR、宏基因组下一代测序(mNGS)和广谱自身免疫性脑炎抗体的检测等。

本期时新文献导读为您分享复旦大学附属华山医院国家传染病医学中心结合mNGS、多重PCR和自身免疫抗体检测,评估一种新的诊断算法的诊断性能、应用以及对患者预后的影响,来优化脑炎/脑膜炎诊疗路径。以及mNGS在脑炎诊断方面的最新进展与案例,请您查阅~


01. 通过精确诊断和治疗(IMPROVE)优化脑炎/脑膜炎路径:一项随机对照试验的研究方案


题目:


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发表杂志:2022年1月《BMC Infect Dis》

IF:3.090

作者单位:复旦大学附属华山医院国家传染病医学中心

摘要:

背景:脑炎/脑膜炎带来了沉重的疾病负担,30-40%的患者疾病原因仍然未知。核酸扩增和自身免疫抗体检测相结合对提高脑炎/脑膜炎的诊断和治疗具有重要意义。此外,虽然多种诊断方法在临床上使用,但公认的、统一的脑炎诊治流程仍不清楚。

方法: IMPROVE是一项多中心、开放、随机对照临床试验,旨在评估一种新的诊断流程的诊断性能、应用和对患者预后的影响,该流程结合了宏基因组下一代测序(mNGS)、多重聚合酶链反应(PCR)和自身免疫抗体检测。入组患者将分为两个平行组,多重PCR检测加自身免疫抗体组(组I)或者mNGS加自身免疫抗体组(组II),患者比例为1:1。两组均将随访12个月。主要结果包括目标治疗的初始时间和试验第30天的Modifed Rankin Scale(MRS)量表评分。次要结果是第14天的脑脊液指标缓解率、第30天的死亡率以及诊断效果的评估。预计这两组人数总共有484人。

讨论:优化脑炎/脑膜炎路径、精准诊断及治疗具有重要意义。快速诊断的效果无疑取决于新的诊断方法的进步,例如多重PCR、mNGS和广谱自身免疫性脑炎抗体检查。这项随机对照研究可以让我们对这些检测的诊断性能、对患者治疗和预后的影响有准确全面的了解。


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注:IMPROVE研究大纲


关键词:诊断;脑炎;脑膜炎;多中心;随机试验;治疗


02. 宏基因组下一代测序(mNGS)诊断儿童脑膜炎和脑炎:综述


题目:


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发表杂志:2021年12月《J Pediatric Infect Dis Soc》

IF3.164

作者单位:美国科罗拉多大学医学院儿科

摘要:

宏基因组下一代测序(mNGS)是一种新的诊断方法,通过对脑脊液中细菌、病毒、寄生虫和真菌的无偏性检测,有可能彻底改变小儿脑膜炎和脑炎的诊断。目前的文献大多是观察性的,且具有不同的适应症、人群和检测时间,从而导致诊断率和临床影响的差异。需要制定诊断管理策略,针对儿童群体,优化检测时间,确保对结果的恰当判读,指导及时优化抗生素。尽管未来还需要进一步研究来收集mNGS对特定儿科患者的临床价值和成本效益数据,这篇综述仍强调了mNGS的临床潜力。


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注:mNGS在儿童疑似中枢神经系统感染诊断中的应用总结


关键词:诊断管理;脑炎;脑膜炎;宏基因组下一代测序;儿科


03. 脑脊液宏基因组下一代测序(mNGS)诊断脑曲霉病


题目:


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发表杂志:2021年12月《Front Microbiol》   

IF:5.640

作者单位:解放军总医院海南医院神经内科

摘要:

目的:脑曲霉病(CA)是一种罕见但通常致命的、难以诊断的机会性感染。宏基因组下一代测序(mNGS)用于诊断CA的效用尚不清楚。我们评估了脑脊液(CSF)的mNGS对CA诊断的有用性。

方法:这项前瞻性研究涉及连续7名确诊为CA的患者,对这些患者进行CSF mNGS检测。测定血清(1→3)-β-D-葡聚糖和半乳甘露聚糖水平,并进行脑组织病理学检查和mNGS。收集三名未感染患者的脑脊液,在无菌脑脊液中加入不同浓度的曲霉孢子,mNGS进行敏感性检测以作为阳性对照。

结果:7例确诊的CA病例中有6例CSF的mNGS呈阳性(敏感性为85.71%)。在隐球菌性脑膜炎组(对照组)中,两名患者CSF的mNGS检测曲霉菌呈阳性(特异性为84.62%)。脑脊液中CA的mNGS阳性似然比、阴性似然比和尤登指数分别为5.565、0.169和0.7。在6例mNGS阳性病例中,4例(4/6,66.67%)中发现了两种以上的曲霉菌。在阳性对照中,一个烟曲霉孢子通过mNGS产生了 25.45的标准化物种特异性序列数(SDSSRN,SDSSRN= 25.45 ×(number of spores))。如果SDSSRN为2,则检测率为0.98。

结论:mNGS有助于CA的诊断,并可能减少疑似CA患者的脑活检需要。


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注:7例脑曲霉病的临床特点分析


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注:7例脑曲霉菌病患者脑脊液分析结果及组织病理学结果


关键词:脑曲霉病;脑脊液;诊断;宏基因组下一代测序;病原体


04.通过脑脊液和血液样本下一代测序诊断儿童福氏纳格里阿米巴引起的原发性阿米巴脑膜脑炎


题目:


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发表杂志:2021年12月《BMC Infect Dis》

IF:3.090

作者单位:广西医科大学第一附属医院儿科

摘要:

背景:原发性阿米巴脑膜脑炎(PAM)是一种罕见的、急性和致命的中枢神经系统疾病,由福氏纳格里阿米巴感染引起。目前,文献报道的大部分病例都是通过检测脑脊液(CSF)中的病原体诊断出来的。本报告介绍第一例经宏基因组新一代测序(mNGS)验证的8岁男童脑脊液和血液中阿米巴浸润的儿童PAM。

病例介绍: 一名8岁男童因发热、头痛和呕吐24小时入院,并迅速进入昏迷状态。脑脊液检查符合典型的细菌性脑膜炎。然而,针对这种情况治疗被证明是无效的,患者迅速发展为脑死亡。最后,患者被转诊到我院,确诊为脑死亡,并通过mNGS分析了CSF和血液样本。在两个样本中都检测到了福氏纳格里阿米巴,血液中的序列数低于脑脊液,再通过PCR和Sanger测序进一步验证了病原体诊断。

结论:这是中国大陆发现的首例儿科PAM病例。结果表明,福氏纳格里阿米巴可能通过受损的血脑屏障扩散到中枢神经系统。


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注:两次脑脊液临床检测结果


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注:患者的头/颈部MRI扫描


图像显示双侧大脑半球、基底节、丘脑、脑干、小脑半球有异常信号,并显示广泛的脑水肿;第四脑室、环状池、脑桥池和脑外空间狭窄,小脑扁桃体下边缘变尖,轻微向下移动

关键词:血;脑脊液;宏基因组学下一代测序;福氏纳格里阿米巴;原发性阿米巴脑膜脑炎


05. 一例HIV阳性患者由马尔尼菲篮状菌和黑曲霉引起的脑血管炎:病例报告并文献综述


题目:


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发表杂志:2022年1月《J Neurovirol》

IF:2.643

作者单位:福建中医药大学附属第三人民医院脑病科

摘要:

脑血管炎是一个重要的临床研究课题。感染是脑血管炎的常见原因,由于涉及特定的抗感染治疗,因此诊断至关重要。一名65岁男子因神经系统症状到医院就诊,没有明显诱因。入院后,放射学检查和全面的常规微生物学检查(CMTs)显示疑似颅内感染性血管炎。宏基因组二代测序(mNGS)和逆转录聚合酶链反应进一步证实,其脑血管炎是由马尔尼菲篮状菌和黑曲霉共同感染引起的。患者的诊断从最初的疱疹性脑炎(既往有头面部疱疹病史但抗病毒治疗效果不佳)最终转变为真菌性脑血管炎。患者在入院第18天接受抗真菌治疗后出院,3周后随访时相关症状完全消失。

本文证明了在HIV阳性患者中存在由马尔尼菲篮状菌和黑曲霉引起的罕见脑血管炎。对于临床疑似感染性脑血管炎患者,如果CMTs不能提供有用的诊断线索,应进行mNGS检测潜在病原体,凸显mNGS在感染性疾病诊断和治疗中的重要性。


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注:影像学和脑脊液细胞学检查结果


(a)脑脊液细胞学检查图像,红色箭头表示从左到右的活性单核细胞和浆细胞;(b)脑MRI结果,这些图像从左到右和从上到下成对排列,分别代表 T1、T2、Flare 和 DWI;(c)脑血管造影检查,异常信号用红色箭头表示

关键词:黑曲霉;脑血管炎;人类免疫缺陷病毒;宏基因组下一代测序;马尔尼菲篮状菌

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