血流感染是严重的全身感染性疾病，严重威胁患者生命。为规范血流感染临床检验路径，实现精准诊疗，《中华传染病杂志》最新发布《血流感染临床检验路径专家共识》。共识针对血流感染的流行病学、风险分级的诊断流程、检验技术评价、检验路径、报告出具及结果解读等方面进行了综合分析，并建议针对疑似真菌性、病毒性和高度怀疑合并严重脓毒症患者在送检血培养的同时联合送检基于核酸检测的病原体快速鉴定。
此外，本期时新文献还探讨了《BMJ》最新研究，Xpert Ultra在低结核病负担国家诊断儿童结核病的准确性，Xpert Ultra的灵敏度显著高于Xpert检测，但特异性略低。因此，在评估儿童疑似肺结核中，可优先使用Xpert Ultra。瑞金医院研究团队在中国17家医院对急诊或住院48小时内的SCAP患者进行了一项多中心前瞻性研究，发现流感病毒、肺炎链球菌、肠杆菌是中国SCAP的主要致病原。欢迎收看本期时新文献导读！
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血流感染临床检验路径专家共识
文献信息
发表时间及杂志：
2022年8月 《中华传染病杂志》
通讯作者：
吴文娟（同济大学附属东方医院南院检验科）
李 敏（上海交通大学医学院附属仁济医院检验科）
陈德昌（上海交通大学医学院附属瑞金医院重症医学科）
摘要
血流感染是严重的全身感染性疾病，其诊断及时性、准确性，以及初始抗微生物药物的合理应用与临床检验密切相关。为规范血流感染的临床检验路径，实现早期诊断、个体化精准治疗，以及改善患者临床预后，相关领域专家起草了《血流感染临床检验路径专家共识》，从基于风险评估的诊断流程、临床标本采集、检验技术评价、报告出具及结果解读等方面，提出相关推荐意见，为临床医师、检验医师、技术人员及卫生管理人员提供参考依据。
注：血流感染临床检验路径流程图
共识共推荐22条意见，其中强推荐意见1条，弱推荐意见6条，弱不推荐意见1条，专家建议14条。本共识旨在为检验医师、临床微生物检验从业人员及临床医师提供血流感染诊断相关参考依据，以期规范血流感染的临床检验路径，做到早期诊断、个体化精准治疗，最终改善血流感染患者的临床预后，提高血流感染患者的生存率。
表1：不同病原体的检测方法和标本要求
关键词：血流感染；临床检验；抗微生物药物；路径
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XpertUltra在低结核病负担国家诊断儿童结核病的准确性：一项前瞻性多中心研究
文献信息
Accuracy ofXpert Ultra for the diagnosis of paediatric tuberculosis in a low TB burdencountry: a prospective multicentre study
发表时间及杂志：2022年7月《BMJ》
IF：20.79
作者单位：
西班牙格雷戈里奥·马拉尼翁大学
背景
儿童肺结核（TB）诊断仍是当代医学的挑战。本研究旨在评估Xpert Ultra在低TB流行环境中诊断儿童肺结核的性能。
方法
采用前瞻性、多中心、诊断准确性研究。在西班牙的11所儿科单位招募了临床或放射学疑似肺结核的儿童。每位患者在入院3天内最多采集三份胃吸取物或痰标本，并通过Xpert Ultra、Xpert MTB/RIF和平行培养进行分析。
结果
86名儿童患者被纳入研究(中位年龄4.9岁，51.2%为男童)。75名患者(87.2%)最终诊断为肺结核；33名(44.0%)通过微生物学鉴定。共分析了219个标本，包括胃吸出物(n=194；88.6%)和痰标本(n=25；11.4%)。以培养结果作为参考标准，其中Xpert MTB/RIF的灵敏度为37.8%，Xpert Ultra的灵敏度为 81.1%；特异性分别为98.4%和93.4%。在针对患者的分析中，综合考虑不同标本的阳性结果，Xpert MTB/RIF的灵敏度为 42.9%，Xpert Ultra的灵敏度为81.0%；特异性分别为96.9%和87.7%。
注：Xpert Ultra、Xpert MTB/RIF和培养三种方法的阳性样本分析
注：Xpert Ultra和Xpert MTB/RIF在每位患者和每份样本中的敏感性和特异性分析
结论
在低结核流行环境中的肺结核患儿中，Xpert Ultra的灵敏度显著高于Xpert检测，而特异性略低于Xpert MTB/RIF。因此，在接受疑似肺结核评估的儿童中，应尽可能优先使用Xpert Ultra而不是Xpert MTB/RIF。
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中国成人重症社区获得性肺炎病原学调查：一项综合利用多种检测手段前瞻性多中心研究
文献信息
Aetiology ofsevere community acquired pneumonia in adults identified by combined detectionmethods：a multi-centre prospective study inChina
发表时间及杂志：
2022年1月《Emerging Microbes &Infections》
IF：19.57
作者单位：上海交通大学医学院附属瑞金医院
摘要
重症社区获得性肺炎(SCAP)对全球公共卫生构成严峻挑战。在过去几年中分子病原检测技术发展迅速，研究团队于2018年6月至2019年12月，在中国17家医院对急诊或住院48小时内的SCAP患者进行了一项多中心前瞻性研究，所有临床数据均上传至在线数据库。采集患者血液、尿液和呼吸道标本进行常规培养、抗原检测、PCR和mNGS检测。由主管医生团队和本研究专家组根据各检测结果、患者临床特征和治疗反应确认本次致病原。
注：重症社区获得性肺炎患者的病原鉴定结果分析
柱状图显示275例患者共检出222种病原菌，其中198例病原学结果阳性。中间饼图显示了单一感染、阴性和共感染的比例，在198例明确病原体的患者中，174例(87.9%) 是由单一病原体感染引起的，24例(12.1%) 是由两种或多种病原体混合感染引起的；右侧饼图显示了合并感染的比例。
本研究共纳入275名患者，在综合检测手段下病原检出率为74.2%(222/299)，而常规培养为14.4%(43/299)，不使用mNGS时为40.8%(122/299)。SCAP的五大常见致病原依次为流感病毒(23.2%)、肺炎链球菌(19.6%)、肠杆菌(14.6%)、嗜肺军团菌(12.6%)、肺炎支原体(11.1%)。综合检测方法提高了致病原检出率，明确致病原与未明确患者的住院死亡率分别为21.7%(43/198)和25.9%(20/77)。流感病毒、肺炎链球菌、肠杆菌是中国SCAP的主要致病原，其中流感有明显的季节分布性。同时，需要重视包括鹦鹉热衣原体和钩端螺旋体在内的非常见病原体引起的感染。
注：重症社区获得性肺炎患者感染的病原体结果与临床结局
肺炎链球菌、肺炎支原体及嗜肺军团菌等病原体感染患者住院期间康复率均不低于80%(B)；铜绿假单胞菌、肠杆菌科细菌和流感病毒感染患者的住院死亡率较高，分别为42.9%、41.4%和23.9%(C)。
关键词：重症社区获得性肺炎；mNGS；联合检测；多中心研究；鹦鹉热衣原体
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血浆宏基因组下一代测序对重症监护室颈椎损伤脓毒症患者的潜在影响：一项回顾性研究
文献信息
Potentialclinical impact of metagenomic next-generation sequencing of plasma forcervical spine injury with sepsis in intensive care unit: A retrospectivestudy
发表时间及杂志：2022年8月《Front Cell Infect Microbio》
IF：6.07
作者单位：上海长征医院急诊与重症医学科
摘要
颈椎损伤(CSI)是重症监护病房(ICU)主要的死亡原因，而脓毒症是CSI患者死亡的主要原因之一。然而，目前尚无及时诊断脓毒症的有效方法。本研究探讨宏基因组下一代测序(mNGS)对CSI脓毒症患者的病原体特征和预后预测的影响。对17名患者的27份血液样本进行了mNGS检测，并与常规培养方法进行比较。
注：mNGS的诊断性能
结果
mNGS在CSI脓毒症患者中检测到多种病原体，包括129种细菌、8种病毒和51种真菌，阳性率为85.2%。以血培养为金标准，mNGS的敏感性和特异性分别为66.7%和12.5%，阳性预测值(PPV)和阴性预测值(NPV)分别为8.7%和75.0%；结合血培养和其他培养结果(痰液、导管引流液、尿液)为金标准，mNGS的敏感性和特异性分别为86.4%和20.0%。传统的培养方法在血液样本中仅显示11.1%的阳性率。
进一步分析显示，mNGS对ICU中的CSI脓毒症患者预后无明显影响，而血培养阳性结果与风险比(HR)增加密切相关。研究结果也表明当CSI病例被诊断为脓毒症时，应用mNGS可能为临床医生使用抗生素提供证据。
关键词：ICU；回顾性研究；颈椎损伤；mNGS；脓毒症
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血液宏基因组下一代测序在结缔组织病患者中的应用价值
文献信息
Applicationvalue of blood metagenomic next-generation sequencing in patients with connectivetissue diseases
发表时间及杂志：
2022年8月《Front Immunol》
IF：8.79
作者单位：山西医科大学第二医院风湿病科
目的
本研究旨在分析血液宏基因组下一代测序(mNGS)在结缔组织病(CTDs)患者中的应用价值，为感染诊断和治疗提供参考。
方法
针对2020年1月至2021年12月在山西医科大学第二医院风湿病科住院的126例疑似感染CTD患者，对mNGS和常规检测结果(CDT)进行了回顾性分析。
结果
系统性红斑狼疮(SLE)和多发性肌炎/皮肌炎(DM/PM)患者的感染发生率最高。mNGS的阳性检出率高于CDT。病毒感染是CTD患者最常见的单一或混合感染类型，其次是细菌和真菌感染。EBV、CMV和HSV1是常见的病毒类型。罕见病原体如耶氏肺孢子菌引发的血流感染应引起重视。同时，最常见的混合感染类型是细菌和病毒感染。
注：CTD患者外周血mNGS与常规检测方法（CDT）检测结果比较
结论
mNGS技术灵敏度高、检测范围广，在疑似混合感染的CTD患者中具有重要的应用价值。此外，CTD患者机会性病毒感染的高发生率应该引起足够的关注。
关键词：结缔组织病；mNGS；病毒感染；EBV；CMV
