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【IDSC会议精彩采撷】备受瞩目的mNGS将会走向何方?

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发表时间:2021-12-13 12:00

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10月30日,由中国医药教育协会主办,IDSA(美国感染病学会)、ESCMID(欧洲临床微生物学和感染病学会)协办,中山大学附属第一医院承办,以“学科联合,控感抗疫”为主题的中国医药教育协会感染疾病专业委员会(IDSC)第七届学术大会圆满落下帷幕。本次会议就感染性疾病诊治、抗菌药物合理应用等热点、难点问题进行线上+线下同步深入探讨和交流。


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俞云松教授与管向东教授做大会致辞


在感染性疾病诊断领域备受瞩目的mNGS技术也是本次会议的焦点之一。相比于肿瘤、生育等其它NGS应用领域,mNGS技术“难度系数”更高,需要临床、检验、企业等多方面共同推进。因此在29日下午的mNGS专场中,有企业、微生物与临床专家,分别从mNGS技术特点层面介绍升级方向;从实验室规范与报告解读等方面强调mNGS规范化、标准化;从不同症候群分享mNGS应用进展与现存问题,为与会与线上的专家提供了一场思想碰撞的饕餮盛宴。

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陈佰义教授与胡付品教授主持会议

微远基因研发总监曾伟奇博士进行分享


mNGS临床应用进展与发展方向

中国在过去5年的mNGS临床转化研究中,在科研成果,临床应用经验,不同领域mNGS专家共识发表等层面取得了丰硕成果。然而相比于同为NGS临床转化应用的肿瘤与无创产前诊断领域,mNGS临床应用领域因其无偏好性覆盖多种病原体,面对的患者群体特殊,结果解读复杂等诸多因素,面临的挑战巨大。

国家卫健委临检中心在全国开展的室间质评是最具权威性和公信力的检测考评项目2021年,国家卫健委临检中心开展了mNGS室间质评项目,纳入了mNGS领域所有主流的检测单位,对mNGS检测性能进行了评估(相关研究成果发表于Journal of Advanced Research,IF=10.5)。相比于无创产前(83/84家实验室满分)和肿瘤(42/92家实验室满分)NGS检测,感染领域各单位mNGS检测能力(5/90家实验室满分)不容乐观。而微远作为行业引领者,是唯一一家满分的企业。

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对疑似感染的患者群体,当出现mNGS报告阴性或结果与临床预期不符,但患者仍存在不明原因发热等症状时,企业在技术研发方向上究竟该如何考虑?是通过不断优化mNGS技术确认疑似病原还是另寻它因,尝试分析从宿主信息中找寻端倪?本次大会上,各相关单位百花齐放,为技术不断向前推进做出努力。曾博指出,微远通过历经三年深入技术研发后,同比评估多种技术可行性后提出了通过全靶向捕获技术为临床提供更优质解决方案这一新方向。


mNGS技术迭代新方向:

宏基因组全靶向捕获技术IDseq Ultra

真阴性还是假阴性?为什么临床培养出来了mNGS不见病原踪迹?mNGS阳性了一定是感染吗?临床反馈让技术难点逐步浮出水面,人源背景带来的高宿主率导致的mNGS检测灵敏度不足,是现阶段亟待解决的问题。开发一项不惧人源宿主因素干扰,专注“捕获”病原的检测技术,为临床精准诊断赋能势在必行。

全靶向捕获检测技术因全面,不丢失宏基因组“宏”的特点,在重点覆盖重点病原/耐药基因/毒力因子/转录因子的同时,又能广谱兼容新发/罕见特殊病原,成为了微远在未来技术迭代层面的首要选择。而基于靶向扩增的tNGS技术因引物设计存在上限,靶标设计有限,不能覆盖新发、罕见或近缘等未在panel内的病原体,富集灵敏度相对较低,未来在耐药基因、宿主转录组层面等方面拓展受限等因素需要识别与评估。


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IDseqTM Ultra检测特性


为此,微远基因推出宏基因组全靶向捕获产品IDseq™ Ultra,基于15万+真实临床大数据设计百万级探针,全面覆盖20000+临床重要病原体,检测限低至10拷贝/mL,可以将无菌体液检测阳性率提高10~15%,并且重点富集重要病原体及耐药/毒力基因(含结核点突变),实现100倍以上富集的同时,广谱兼容新发、罕见、特殊病原体,兼顾mNGS一网捕获的全靶向优势,不惧人源宿主干扰,真正实现全样本类型(包括全血)检测。


最后,陈佰义教授与胡付品教授感谢所有与会专家的精彩分享与发言,并指出随着mNGS技术迈入2.0时代,mNGS技术不单单是病原体鉴定,还会从宿主、药物维度提升感染精准医学,也相信在企业、检验、临床多方的共同努力下,mNGS技术发展与临床应用会越来越好。

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