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04/02

2022

‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍导读近日,由国家儿童医学中心复旦大学附属儿科医院牵头,国家卫健委科技发展中心督办,多家单位参与的十四五国家重点研发计划“生育健康及妇女儿童健康保障”重点专项项目——“儿童重症感染性疾病精准诊疗和应用”启动会隆重召开。本次启动会由复旦大学、复旦大学附属儿科医院、复旦大学附属华山医院、广州市妇女儿童医疗中心、厦门大学、武汉大学、微...

03/17

2022

伊蒙菌,在你们数据库里面吗?mNGS检出3条鹦鹉热核酸序列,这个结果可靠吗?听说公共数据库污染很严重,你们是怎么做的?……对于以上临床问题,本期内容分两个板块为您详解,数据库上市背后的故事:✓ 微远创始人&CTO许腾博士眼中的数据库✓ 微远生信极客小山狗详解数据库背后的临床价值 也许有人会好奇:“构建一个临床级别的病原宏基因组学数据库并持续升级,重要吗?困难吗?”微远创始人&CTO许腾博士如...

03/14

2022

自2021年11月以来,具有高传染性的新型冠状病毒奥秘克戎变异株在全世界迅速广泛传播,并已成为现阶段引发我国境外输入和本土疫情的流行毒株,面对传播速度如此之强的病毒,相关检测实验室需要具备精准,高效的核酸筛查能力,以及时切断病毒传播途径,阻碍大规模传播。 为了解全国新冠病毒核酸检测实验室对奥密克戎变异株的检测质量,保证核酸检测在应对可能的奥密克戎变异株输入防控中的有效性,国家卫生健康委临床检...
mNGS 文献共识
慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者呼吸道内可发现多种细菌,而慢性阻塞性肺疾病急性加重期的(AECOPD)患者气道内细菌携带状况将发生显著改变。巨噬细胞具有M1和M2两种类型的生物学行为模式,前者对炎症发生发展起促进作用,后者起抑制作用。巨噬细胞生物学行为模式转变受CD163、MARCO、SLAMF8、HLA-C、OLFML2B等基因调控。了解微生物构成和宿主炎症反应变化对于研究COPD患者气...
2022年诺贝尔生理学或医学奖获得者瑞典科学家Svante Pääbo (斯凡特•帕博),利用了探针捕获技术,设计百万条的探针集,在约99.8%的微生物DNA存在的情况下,实现目标序列约190,000倍富集。正因为探针捕获技术能对目标序列以及关键位点进行高效捕获,因此其在古人类DNA研究、外显子测序和肿瘤早筛方面有着广泛的应用。微远基因首次将该技术与mNGS相结合,研发出百万探针捕获的mN...
造成脑炎/脑膜炎的病因中,约20~30%是由自身免疫机制介导,40~50%是由感染引起。尽管有非常多的检测方法,但仍有40-60%的脑炎或脑膜炎患者未能明确病因。在感染的诊治中,病毒检测依赖于以PCR为主的核酸检测技术,其检测性能受限于靶标预设的准确性和病原体核酸载量的高低。 无偏性mNGS检测技术的出现为解决这类问题带来曙光,其打破了预设靶标的限制,全面覆盖新发/罕见病原体,但在临床实践...
mNGS 临床案例
01.病史与主诉 患儿,男,28周,BW 960g。入院日龄:2月23天(纠正39+6周)。主诉“发热半天”。现病史:①G1P1,孕28周,因“先兆早产,胎盘早剥”剖宫产,出生体重960g (P5-10), 羊水血性、脐带螺旋、胎盘水肿,Apgar评分7-8分。 ②2021.9.24-2021.12.14于上海某儿科医院住院,出院诊断“新生儿呼吸窘迫综合征、支气管肺发育不良、超低出生体重儿...
疑惑mNGS回报诺卡菌检出时如何做临床解读? 1诺卡菌是一种“罕见”的条件致病菌,由于传统微生物检测方法在诺卡菌与结核分枝杆菌的鉴别诊断存在挑战,可能存在误诊。随着分子检测方法的应用,诺卡菌属可进一步分型以便临床根据不同感染部位进行2-12个月不等的治疗。在mNGS时代,若回报检出诺卡菌的同时检出病毒,您会如何做临床解读?  案例回顾:老伯7年COPD“结核”似像非像,病毒又来“煽风点火”...
在今年【世界脓毒症日】系列活动中,前两期围绕病毒性脓毒症从时新文献以及高风险患者群体进行了介绍,本期微远基因整理患7年COPD老者急性加重,应用IDseqTM Ultra全流程快速辅助诊断,为临床提供抗微生物药物选择依据,最终患者症状好转出院的典型案例,欢迎查看。 【2022年世界脓毒症日】系列回放:Day1:病毒性脓毒症的流行病学及发病机制Day2:重视“病毒性脓毒症”,让感染诊断快速精准...
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艾静文 博士
共识篇:mNGS应用共识与争鸣
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临床篇:mNGS临床应用进展与未来
张栋 主管技师
检验篇:mNGS平台建设与检测规范
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规范篇:mNGS室间质评与关键要点
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呼吸道病毒感染的病原诊断
王一民 教授
从CAP-China看中国肺炎的新十年
谢菲 教授
呼吸系统感染mNGS临床应用的进展和解读
武立勇  教授
mNGS中枢神经系统感染临床转化与未来
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